A történet középpontjában egy Riko nevű árva kislány áll, aki egy Ószu (Ōsu) nevű városban él Beoluska tenger egyik szigetén. A város egy furcsa, Abyss-nak nevezett ismeretlen gigantikus lyuk körül épült, ami a Föld mélye felé tátong. Az Abyss rengeteg kincset és egy rég elveszett civilizáció nyomait rejti, ezért népszerű hely azon barlangászoknak, vállalják a nehéz és veszélyes ereszkedést köddel teli gödörbe, hogy értékes relikviákat találjanak. Azonban minél mélyebbre hatolva fokozatosan fejti ki végzetes hatását az Abyss átkának nevezett halálos kór. Azon kevesek, akik mégis visszatértek az alsóbb régiókból számolnak be tapasztalataikról. Riko célja, hogy édesanyja nyomdokaiba lépve barlangász mester (Fehér Sípos) lehessen és megoldja Abyss rejtélyét. Egy nap egy Reg nevű emberformájú robotfiúra bukkan a mélységben.