A főhős Eli Shane, aki egy tinédzser. Elszánta magát, hogy a Slugterra legnagyobb hőse lesz. Ezt csak úgy tudja megvalósítani, ha begyűjt valamennyi slugot, tornáztatja őket, és kihívja párbajra a kis lényeket. Mielőtt a Slugterrára érkezett volna, csak egy slug volt nála, a jól ismert Burpy.

Amikor legelőször van Slugterrán, egy újdonsült barátra lel, egy molenoidra, akinek neve Pronto. Ezután Trixie-vel találkozik, aki megvédi egy szélhámos slugharcostól. Majd útja során összefut egy Barlangi Trollal, akinek neve Kord. Pronto, Trixie és Kord segít neki és elindul egy bajnokságon, ahol több slugot tornáztathat és ha nyer, választhat egyet az ellenfél slugjai közül. Ők négyen megalakítják a Shane csapatot, céljuk, hogy megállítsák a gonosz dr. Thaddeus Blakket a hátborzongató slugjaival.